Kamen Rider Black RX adalah versi upgrade dari Kamen Rider Black. ketika Kamen Rider Black berhasil mengalahkan Golgom, duniapun kembali damai. 5 tahun kemudian, ketika Kotaro sedang mengendarai helikopter, terjadi kecelakaan yang disebabkan makhluk luar angkasa Crisis Empire. Tujuan dari Crisis Empire adalah melenyapkan Kamen Rider Black yang menjadi penghalang mereka untuk menguasai Bumi. Kotaro pun terlempar keluar angkasa dan ia dihujani tembakan plasma dari pesawat luar angkasa Crisis Empire. Karena terus menerus ditembaki, Kingstone yang ada pada pinggang Kotaro pun pecah. Dan karena efek kosmik & radiasi matahari, Kingstone berevolusi & menciptakan efek supernova sekaligus menciptakan ledakan yang dahsyat yang menyebabkan Kotaro terlempar kembali ke Bumi. Kotaro pun telah berubah menjadi sosok baru yang lebih kuat lagi yaitu Kamen Rider Black RX. Sekali lagi Kotaro berjuang melawan Crisis Empire untuk melindungi Bumi. Kamen Rider Black RX memiliki senjata berupa pedang Light Saber. Ia memiliki 2 kendaraan yaitu motor Acrobatter yang merupakan upgrade dari Battle Hopper, dan sebuah mobil yang disebut Rideron. Di episode-episode akhir Kamen Rider Black RX, ia dibantu oleh 10 Kamen Rider sebelumnya untuk melawan Crisis Empire.
Kamen Rider Black RX juga bisa berubah menjadi 2 bentuk yaitu ketika ia terpengaruh secara emosional.
Yang pertama adalah perubahan menjadi RX Robo yang merupakan luapan expresi kesedihannya, RX Robo memiliki senjata berupa pistol laser & motor yang disebut Roboizer. Perubahannya menjadi RX Robo membuatnya lebih kuat & memiliki daya tahan yang tinggi tetapi membuatnya menjadi lamban.
Perubahannya yang kedua adalah menjadi RX Bio yang merupakan luapan expresi kemarahannya, dengan perubahan ini RX Bio dapat bergerak lebih cepat & mampu merubah dirinya menjadi semacam energi sinar yang bisa membuatnya terbang dengan cepat. Senjatanya masih menggunakan Light Saber & motornya adalah Mach Jabba.
